mgr Małgorzata Chwalińska
Zainteresowania badawcze
- Użycie technik sekwencjonowania drugiej i trzeciej generacji w badaniach różnorodności słodkowodnych protistów
- Interakcje orzęsków z ich endosymbiontami
- Bioinformatyka
Projekty badawcze
- Fotosymbioza u słodkowodnych orzęsków: badanie różnorodności, funkcjonowania i ewolucji z zastosowaniem sekwencjonowania pojedynczych komórek, Grant Preludium BIS, NCN. Kierownik projektu: dr hab. Anna Karnkowska
- Opracowanie metody wysokoprzepustowego sekwencjonowania transkryptomów z pojedynczych komórek mikroorganizmów eukariotycznych, Nowe Idee, Inicjatywa Doskonałości Uczelnia Badawcza. Kierownik projektu: dr hab. Anna Karnkowska
- Monitoring diversity of microbial dark matter in expanding anoxic zones, projekt w ramach sojuszu 4EU+. Kierownik projektu: Dr Tomas Panek (Uniwersytet Karola)
Staże
- Laboratory of Genomics and Diversity of Prostists, Institute of Parasitology, Biology Center Czech Academy of Science (pod opieką dr. Martina Kolísko), České Budějovice, Czechy (lipiec 2021 – sierpień 2021)
Członkostwo w stowarzyszeniach
- International Society of Protistologists (ISOP)
Konferencje
Prezentacje
- Chwalińska M., Karlicki M., Smacchia V., Karnkowska A. Expanding protist reference sequences databases: a bioinformatic pipeline for obtaining high-quality OTUs from Oxford Nanopore sequencing. ISEP Virtual Meeting. Online; 2023.
- Chwalińska M., Sałek M., Smacchia V., Hałakuc P., Maciszewski K., Karlicki M., Karnkowska A. Freshwater protists diversity elucidated with the short Illumina vs long MinION amplicons of 18S rRNA gene. 51st Jírovec’s Protozoological Days. Hotel Svratka, Czech Republic; 2022.
Postery
- Chwalińska M., Karlicki M., Karnkowska A. 18S rDNA amplicon-based analysis of the diversity of microbial eukaryotes communities in the salinity gradient of Świna river estuary, 9th Intercollegiate Biotechnology Symposium “Symbioza”. Online, 2021.